北京時間2022年12月27日晚上19點,今是科技有限公司(簡稱“今是科技”)首款中通量納米孔基因測序儀Gseq500線上發(fā)布會圓滿落幕。
會上,今是科技創(chuàng)始人兼CEO蘇云鵬博士提到,自2020年發(fā)布首款原理樣機Gseq01以來,公司研發(fā)團隊砥礪前行,不懈創(chuàng)新,將單芯片測序單元數(shù)量提升至512k個,相比Gseq01的 128個提高了4000余倍,同時在測序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確率,讀長等方面實現(xiàn)了綜合性能的大幅飛躍,可滿足大部分包括臨床應(yīng)用場景在內(nèi)的商用需求。
2023年,今是科技將完成生產(chǎn)基地建設(shè)和研發(fā)實驗室擴建,在實現(xiàn)Gseq500批量生產(chǎn)和商業(yè)化銷售的同時,推進高通量納米孔測序儀Gseq10K的研發(fā)與商品化;并建立應(yīng)用研究中心和聯(lián)合實驗室,開發(fā)與測序儀配套的自動建庫設(shè)備及生信分析平臺和數(shù)據(jù)庫等軟硬件平臺,為持續(xù)擴容的市場提供低成本、高效率、自動化的全流程測序解決方案,不斷外延測序應(yīng)用邊界。
蘇云鵬博士
今是科技創(chuàng)始人兼首席科學(xué)官鄒耀中博士,在會上對Gseq500的核心技術(shù)進行了詳細(xì)介紹。鄒耀中博士分享了今是科技過去幾年在納米孔蛋白,高精度+高采樣率的微電流檢測芯片等核心技術(shù)方面取得的實質(zhì)性突破。以芯片為例,今是科技自研芯片在集成度、采樣精度、抗干擾、數(shù)據(jù)傳輸?shù)确矫娑季哂酗@著的性能優(yōu)勢,既保證了測序通量,又能提供更高的數(shù)據(jù)質(zhì)量。
此外,今是科技的芯片支持復(fù)用,復(fù)用次數(shù)可達10次左右,且不會出現(xiàn)性能損耗、降低等問題。樣本具有即來即檢的靈活性,在低開機成本的基礎(chǔ)上實現(xiàn)測序效率的大幅提升。核心零部件與關(guān)鍵技術(shù)均為今是科技自主創(chuàng)新,真正實現(xiàn)中高通量芯片的自主可控與國產(chǎn)替代乃至超越。
鄒耀中博士
同時,為了將繁瑣的實際操作化繁為簡,今是科技還提供預(yù)裝好的全套測序試劑盒,可兼容多種建庫方案,輔以高度自動化的上機流程,包括后續(xù)配備的自動算法軟件處理系統(tǒng),自動生成序列文件進行數(shù)據(jù)分析等,最大程度降低使用門檻,保證客戶使用的便捷性與通用性,使得納米孔測序技術(shù)能靈活地被應(yīng)用于各類場景。
關(guān)于業(yè)界最關(guān)注的測序準(zhǔn)確率問題,在不采用互補序列信息的情況下,Gseq500可提供接近90%的單次測序準(zhǔn)確率(高準(zhǔn)確率模式),當(dāng)測序深度達到30X的時候,校正準(zhǔn)確率可以達到99.95%以上,表現(xiàn)驚艷。即使采取準(zhǔn)確率稍低的“高效率模式”下,30X的讀深也可實現(xiàn)99.9%以上的校正準(zhǔn)確率。隨著未來系統(tǒng)的不斷優(yōu)化,今是科技測序平臺將實現(xiàn)Q40甚至是Q50以上的測序準(zhǔn)確率。
會上,今是科技還邀請到兩位行業(yè)專家,分享了Gseq500在實際應(yīng)用場景中的檢測效果。
中國輸血研究所何苗教授分享了HBV全基因組測序的臨床應(yīng)用及意義
何教授表示,HBV感染仍然是目前最嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題之一。我國現(xiàn)有約1億HBV攜帶者,并且HBV持續(xù)性感染危害性極大?,F(xiàn)在臨床強調(diào)精準(zhǔn)診療,HBV全基因組測序是當(dāng)前個性化乙肝治療的基礎(chǔ),對于HBV的精準(zhǔn)分型和遺傳多樣性研究至關(guān)重要。
納米孔測序技術(shù)相較于金標(biāo)準(zhǔn)的一代測序,可以更好地保留突變連鎖信息-即完整的單倍型,分析其感染比例且擁有較高的準(zhǔn)確率。通過對比今是科技和牛津納米孔(ONT)的數(shù)據(jù)質(zhì)量,今是科技納米孔測序儀獲得的數(shù)據(jù)校正準(zhǔn)確率高達99.95%,優(yōu)于ONT的校正準(zhǔn)確率99.7%。
何苗教授分享
談及HBV納米孔測序應(yīng)用的展望,何教授表示,隨著低成本納米孔測序技術(shù)在HBV全基因組臨床檢測普及應(yīng)用,更多研究將立足病毒性肝炎治療的重大需求,以精準(zhǔn)基因分型為切入點,結(jié)合基于納米孔測序的多組學(xué)分析,通過聚焦個性化精準(zhǔn)治療策略及HBV耐藥新機制,提高實際臨床中的治療效果。
上海市生物醫(yī)藥技術(shù)研究院鄭華軍教授則分享了納米孔測序儀在靶向測序中的應(yīng)用
上海市生物醫(yī)藥技術(shù)研究院的前身,是國家人類基因組南方研究中心和上海生物信息技術(shù)研究中心。作為國內(nèi)最早開展基因組研究的機構(gòu)之一,上海市生物醫(yī)藥技術(shù)研究院擁有豐富且先進的測序儀器與研究技術(shù)。會上,鄭教授分享了今是科技Gseq500測序儀在病原微生物檢測及人類遺傳病真假基因突變檢測方面的應(yīng)用成果。
關(guān)于膿毒癥患者腸道病原菌監(jiān)測,鄭教授表示,目前院內(nèi)繼發(fā)性感染是膿毒癥患者致死的重要并發(fā)癥之一,全球每天約有1.4萬人因此喪命。為解析膿毒癥患者院內(nèi)繼發(fā)感染機制,基于Gseq500納米孔測序技術(shù)長讀長及快速準(zhǔn)確等優(yōu)勢,鄭教授團隊設(shè)計了同時覆蓋多種病原菌的gene panel(1kb以上片段)快速檢測策略。通過將Gseq500測序平臺所測實驗結(jié)果與二代測序結(jié)果相比得出,主要病原都能匹配且趨勢一致,表明Gseq500在病原檢測上有很好的應(yīng)用前景。隨著16s rRNA納米孔測序技術(shù)的進一步提升,未來測序精確度也會隨之提高。
鄭華軍教授線上分享
另外,關(guān)于成人多囊腎遺傳突變位點的檢測,目前主要致病基因PKD1在Chr16有6個高度同源(97%)的假基因。如果使用常規(guī)的二代測序技術(shù),則會影響正確的測序片段定位和分析,包括long PCR+PacBio的檢測方式也會存在擴增效率和特異性等問題,嚴(yán)重影響檢測的準(zhǔn)確性。
針對這一臨床檢測中的難點,鄭教授團隊設(shè)計了10對引物(分別覆蓋1.1kb~6.7kb區(qū)域)在Gseq500納米孔測序儀上進行驗證。檢測樣本不同外顯子區(qū)域單次測序平均準(zhǔn)確度為85%左右,經(jīng)過校正,其準(zhǔn)確率達到100%,這表明Gseq500納米孔測序儀即使是在需要高準(zhǔn)確率的臨床靶向測序領(lǐng)域也具有廣泛應(yīng)用前景。隨著技術(shù)的發(fā)展和精度的提升,Gseq500納米孔測序儀憑借方便快捷與低成本的優(yōu)勢,將助推我國臨床檢測事業(yè)又上新臺階。
鄭華軍教授線上分享
會上,相關(guān)行業(yè)專家也對今是科技納米孔測序儀進一步的應(yīng)用充滿著期待并寄予厚望。今是科技所推出的Gseq500將適合多種不同的應(yīng)用場景,既包括學(xué)術(shù)科研、檢驗檢疫、病原微生物、司法鑒定等,也可以在一些特定臨床應(yīng)用上尋求突破。隨著技術(shù)的精進與產(chǎn)品迭代,Gseq系列測序平臺還將不斷擴大其應(yīng)用場景,助力人們解開更多生命密碼。
預(yù)計到2024年,今是科技將推出具有單芯片10M獨立測序單元的高端測序設(shè)備,數(shù)據(jù)產(chǎn)出超過1Tb,實現(xiàn)Q50以上的校正準(zhǔn)確率,滿足廣泛的臨床應(yīng)用需求。在測序領(lǐng)域的廣度上,今是科技也將繼續(xù)研發(fā),計劃從2023年下半年開始陸續(xù)推出RNA直接測序功能、基于優(yōu)化的Gseq算法平臺的表觀遺傳學(xué)(單堿基分辨率甲基化測序等)分析功能,為各界提供更完備、更多樣的遺傳信息。
點擊鏈接觀看今是科技“新四代納米孔基因測序儀Gseq500新品發(fā)布會”回放視頻:
http://pc.vshibo.xin/live/index?id=1418&mid=undefined
據(jù)悉,今是科技Gseq500納米孔基因測序儀產(chǎn)品預(yù)計在2023年三季度實現(xiàn)商用交付,屆時今是科技會第一時間在官方渠道及相關(guān)媒體平臺發(fā)布相關(guān)信息,請感興趣的朋友們保持關(guān)注。如果您對我司納米孔基因測序儀感興趣,歡迎撥打我司電話028-87455350
今是科技Gseq 500測序平臺
關(guān)于今是
今是科技致力于使基因測序成為精準(zhǔn)醫(yī)療的常規(guī)手段,提升人類健康水平。公司基于“納米孔+邊合成邊測序”的技術(shù)路線研發(fā)的高通量納米孔測序儀,解決了基因測序成本高、效率低、數(shù)據(jù)質(zhì)量不佳的痛點,可實現(xiàn)“幾小時、幾百元”就能進行人類全基因組測序的目標(biāo),有望推動納米孔基因測序儀在臨床市場的廣泛應(yīng)用。
轉(zhuǎn)自:永州新聞網(wǎng)
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