首個(gè)國產(chǎn)三代測(cè)序儀投產(chǎn) 將再次大幅降低成本


來源:21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道   時(shí)間:2017-08-02





  中國首個(gè)應(yīng)用于臨床的第三代測(cè)序儀投產(chǎn),有望把一個(gè)人的全基因測(cè)序成本從1000美元降至100美元,但仍需進(jìn)一步完善相關(guān)技術(shù)。


  7月31日,南方科技大學(xué)生物系80后教授、瀚?;騽?chuàng)始人賀建奎宣布,自主研發(fā)的第三代基因測(cè)序儀GenoCare正式投產(chǎn),首筆訂單達(dá)到700臺(tái)測(cè)序儀。


  21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者獨(dú)家獲悉,該筆訂單合同期三年,購買方包括國內(nèi)外研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)療機(jī)構(gòu)。目前測(cè)序儀已在科研市場(chǎng)應(yīng)用,但投入臨床市場(chǎng)所需的批文還在申報(bào)中。


  賀建奎表示:“我們使用單分子測(cè)序,不需要擴(kuò)增,并可大幅降低試劑消耗量,同時(shí),所有試劑、儀器都在國內(nèi)生產(chǎn)、集成和組裝,成本因此降低,一個(gè)人的全基因組測(cè)序價(jià)格可降到100美元。”


  截至目前,全球自主研發(fā)三代測(cè)序儀的企業(yè)只有三家,另外兩家分別是美國Pacific Biosciences和英國Oxford Nanopore Technologies.


  過去的十余年里,三代測(cè)序主要在科研市場(chǎng)嶄露頭角,但因錯(cuò)誤率高、成本高等原因始終未能進(jìn)入臨床市場(chǎng),更談不上產(chǎn)業(yè)化。


  目前,基因測(cè)序市場(chǎng)的主流是二代測(cè)序,三代測(cè)序的樣本量、數(shù)據(jù)量需要積累,中下游應(yīng)用開發(fā)也剛起步。即便是應(yīng)用相對(duì)廣泛的二代測(cè)序,在各病種的覆蓋率也不算高,三代測(cè)序的普及之路更為漫長(zhǎng)。


  研發(fā)破壁估值15億


  瀚?;蛞验_始在羅湖蓮塘工業(yè)園建設(shè)1萬平米的第三代測(cè)序儀生產(chǎn)線,建成之后產(chǎn)能將達(dá)到每年1000臺(tái),產(chǎn)生50億元價(jià)值。


  “除團(tuán)體訂單外,我們的測(cè)序儀沒有公開發(fā)售,價(jià)格還不能透露,”賀建奎表示,“目前已進(jìn)入小批量試產(chǎn)階段,年底生產(chǎn)線建好后可以大批量生產(chǎn),年終可接受國內(nèi)外醫(yī)院、科研機(jī)構(gòu)訂單,到明年年初,群眾就能用到三代測(cè)序服務(wù)了。”


  深圳一名熟悉瀚?;虻耐顿Y機(jī)構(gòu)合伙人告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者:“瀚?;虻募夹g(shù)是吸收后創(chuàng)新。”


  記者了解,賀建奎在斯坦福大學(xué)的導(dǎo)師斯蒂芬·奎克教授是一位擁有12家公司的企業(yè)家,也是世界上首個(gè)第三代單分子測(cè)序儀Helicos的發(fā)明人。資料顯示,Helicos公司于2004年創(chuàng)辦,并于2012年破產(chǎn)。


  也是在2012年,賀建奎完成斯坦福大學(xué)博士后研究員的工作,回國入職南方科技大學(xué),成為該校生物系第一位教師。同年,他創(chuàng)辦了瀚?;?,啟動(dòng)國產(chǎn)三代測(cè)序儀研發(fā)。


  起初行業(yè)內(nèi)外對(duì)這一項(xiàng)目并不看好,瀚海基因前4年也一直沒有銷售收入,研發(fā)遭遇資金危機(jī),兩次險(xiǎn)些關(guān)門倒閉。賀建奎直言:“一開始見了20多位風(fēng)險(xiǎn)投資人,無一例外都被拒絕,理由之一是當(dāng)時(shí)還沒有在職教授創(chuàng)業(yè)的例子。”


  另外,測(cè)序儀研發(fā)難度非常大,國產(chǎn)三代測(cè)序儀更是首次嘗試。賀建奎指出:“基因測(cè)序的樣品前處理非常復(fù)雜,耗費(fèi)時(shí)間、人力,還需要有后續(xù)的生物信息及專業(yè)人才。三代測(cè)序儀要把這些集成在一起,改變二代測(cè)序的半自動(dòng)場(chǎng)景,測(cè)完自動(dòng)完成生物信息學(xué)分析,難度不小。”


  測(cè)序儀研發(fā)對(duì)人才要求很高,其涉及光學(xué)、流體、化學(xué)、分子生物學(xué)、生物信息學(xué)和精密機(jī)械等,需要多學(xué)科交叉知識(shí)和人才。


  即便到了今天,瀚海對(duì)人才的渴求依舊躍然紙上。記者獲悉,與生產(chǎn)線同時(shí)啟動(dòng)的是瀚海研究院計(jì)劃,預(yù)計(jì)未來5年引入至少50名遺傳解讀分析專家以及50名醫(yī)學(xué)專家(包括生殖、腫瘤、傳染病等各學(xué)科).


  2015年,瀚?;蚪K于拿到第一筆大額融資——南京中正科技投資1700萬元,同年,瀚?;虬l(fā)布了GenoCare原理樣機(jī)。此后,公司身價(jià)一路水漲船高,目前共獲得5輪、2億元風(fēng)險(xiǎn)投資,測(cè)序儀雖未真正走向市場(chǎng),但估值已達(dá)15億元。


  深圳一名中小企業(yè)投資機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者:“去年11月我們?nèi)タ吹臅r(shí)候,估值已經(jīng)10億元了,項(xiàng)目還很早期,對(duì)我們來說太貴,投不起。”


  產(chǎn)業(yè)化起步大幅降低成本


  采訪過程中,賀建奎多次提到,降低臨床基因測(cè)序成本,這也是二代測(cè)序儀的發(fā)力方向。


  原中國科學(xué)院北京基因組研究所副所長(zhǎng)于軍指出:“第一代測(cè)序儀測(cè)一個(gè)人的基因組測(cè)序接近30億美元,第二代降到1000美元,第三代使用單分子測(cè)序,不需要擴(kuò)增,價(jià)格有望降到100美元。”業(yè)內(nèi)將其稱為摩爾定律,以說明價(jià)格急劇下降趨勢(shì)。


  翻看基因測(cè)序成長(zhǎng)史,第一代測(cè)序技術(shù)主要基于Sanger雙脫氧終止法的測(cè)序原理,結(jié)合熒光標(biāo)記和毛細(xì)管陣列電泳技術(shù)來實(shí)現(xiàn)測(cè)序自動(dòng)化,基本方法是鏈終止或降解法,人類基因組計(jì)劃就是基于一代測(cè)序技術(shù)。


  第二代測(cè)序技術(shù)設(shè)備供應(yīng)商主要是Illumina,業(yè)內(nèi)普遍認(rèn)為,其市場(chǎng)占有率達(dá)到70%。今年年初,Illumina公司宣布推出NovaSeq系列測(cè)序儀,據(jù)稱,其簡(jiǎn)捷操作、低成本及靈活性有望將基因組測(cè)序成本降至100美元。


  根據(jù)Illumina2017年第一季度財(cái)報(bào),Illumina共收到135個(gè)NovaSeq測(cè)序儀訂單。不過,中國科學(xué)院院士陳潤(rùn)生指出:“NovaSeq系列測(cè)序儀的使用窗口目前沒有開放。”


  國內(nèi)基因企業(yè)也在通過技術(shù)合作、收購等方式破壁測(cè)序儀國產(chǎn)化。如Illumina和貝瑞和康、安諾優(yōu)達(dá)開發(fā)了一款適用于無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)的二代測(cè)序儀NextSeq CN500和NextSeq 550AR,并已獲得CFDA批準(zhǔn)。


  華大基因通過收購的方式布局,先后推出三款國產(chǎn)二代測(cè)序儀。華大基因CEO尹燁此前向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者透露:“算上臨床機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)和友商,國內(nèi)應(yīng)該已經(jīng)超過兩百多臺(tái)我們的測(cè)序儀在‘服役’了。”


  第三代測(cè)序技術(shù)原理最早發(fā)表于2003年,后來,Pacific Biosciences和Oxford Nanopore相繼入局,Pacific Biosciences于2015年10月推出小型單分子測(cè)序儀Sequel。一名基因測(cè)序公司技術(shù)總監(jiān)告訴記者:“中國市場(chǎng)目前唯一的三代測(cè)序儀就是這家公司提供,也是針對(duì)科研市場(chǎng)。”


  英美測(cè)序儀的研發(fā)起步雖早,但進(jìn)展一直緩慢,臨床應(yīng)用更談不上。瀚?;蚧瘜W(xué)部副總監(jiān)趙陸洋告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者:“三代測(cè)序儀很受科研市場(chǎng)歡迎,因其提供了RNA直接測(cè)序的可能性,這是二代測(cè)序做不到的。”


  上述投資機(jī)構(gòu)合伙人表示:“科研型測(cè)序儀對(duì)易用性、可靠性要求低一些,對(duì)可調(diào)節(jié)因素要求高一些,也不需要申請(qǐng)注冊(cè)證。相比之下,臨床市場(chǎng)的門檻高很多,空間也比較大。”


  雖然瀚海基因?qū)ψ约旱臏y(cè)序儀信心滿滿,但在評(píng)價(jià)一款基因測(cè)序儀的三大核心指標(biāo):通量、讀長(zhǎng)、準(zhǔn)確度方面,瀚海基因卻三緘其口。


  據(jù)賀建奎介紹,GenoCare第三代基因測(cè)序儀的核心技術(shù)為單分子熒光測(cè)序,此項(xiàng)技術(shù)使用全內(nèi)反射熒光成像方法,能夠檢測(cè)單個(gè)熒光分子,無需PCR擴(kuò)增。


  資料顯示,二代基因測(cè)序技術(shù)在上機(jī)測(cè)序前需要對(duì)樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,可以在試管里、在很短的時(shí)間內(nèi),將待測(cè)基因擴(kuò)增50萬倍乃至上百萬倍,這能提高基因診斷的靈敏度,但帶來問題是實(shí)驗(yàn)要求比較高,成本也居高不下。


  同時(shí),賀建奎團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中美兩國科學(xué)家協(xié)作使用Genocare對(duì)大腸桿菌測(cè)序。數(shù)據(jù)結(jié)果顯示,Genocare與測(cè)序行業(yè)龍頭Illumina生產(chǎn)的MiSeq二代基因測(cè)序儀的一致性達(dá)到99.7%。


  “預(yù)計(jì)明年年初會(huì)公開發(fā)售價(jià)格。臨床實(shí)驗(yàn)也已經(jīng)啟動(dòng)了,在走試驗(yàn)、申報(bào)流程。其他領(lǐng)域如科研市場(chǎng)不需要醫(yī)療器械證就可以使用,這些領(lǐng)域已經(jīng)有我們的測(cè)序儀在應(yīng)用了。”賀建奎說。


  應(yīng)用存短板核心部件依賴進(jìn)口


  研發(fā)出三代測(cè)序儀后,瀚?;蛞幻嬉苿?dòng)大批量生產(chǎn),一面要開拓中下游。


  目前,基因測(cè)序已形成了明確的產(chǎn)業(yè)鏈分工:上游為設(shè)備和耗材供應(yīng)商;中游為第三方測(cè)序服務(wù)供應(yīng)商,需依賴設(shè)備投入、運(yùn)營(yíng)管理與終端維護(hù)開發(fā);下游為生物信息分析服務(wù)商。


  賀建奎闡述了瀚?;虻纳虡I(yè)模式:“中游的應(yīng)用開發(fā)比如腫瘤基因檢測(cè)、遺傳基因檢測(cè)、傳染病檢測(cè),通過合作伙伴來完成。希望越來越多的測(cè)序服務(wù)公司和相關(guān)的機(jī)構(gòu)在我們測(cè)序儀上開發(fā)各類疾病檢測(cè),形成生態(tài)圈,并且通過他們或者其他人把測(cè)序儀銷售到醫(yī)院。”


  上下游企業(yè)的互相“成全”,也是Illumina和華大基因成長(zhǎng)的路子。


  前述投資機(jī)構(gòu)合伙人指出:“華大基因向Illumina購買了100多臺(tái)測(cè)序儀才成為第一,華大基因也通過這些測(cè)序儀開發(fā)出了很多服務(wù)。測(cè)序儀未來的銷售量如何,可能要依靠整個(gè)行業(yè),包括合作伙伴、臨床以及科研機(jī)構(gòu)有沒有充分地把臨床意義和科研意義發(fā)揮出來。”


  記者在瀚?;驕y(cè)序儀上市發(fā)布現(xiàn)場(chǎng)注意到,華大基因、北科生物、從事體外診斷的安圖生物等都有相關(guān)負(fù)責(zé)人到場(chǎng),這些都是瀚海的潛在合作伙伴。


  不過,是否牽手瀚?;蜻€需要考量。一家生物技術(shù)公司產(chǎn)品部負(fù)責(zé)人告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者:“瀚海的測(cè)序儀一次只能測(cè)一個(gè)人的全基因組,Illumina的人數(shù)會(huì)多一點(diǎn)。另外,現(xiàn)在體外診斷主要還是對(duì)已知疾病的檢測(cè),瀚?;蛑饕窃缙诤Y查,這雖然是趨勢(shì),但目前市場(chǎng)有限,二代測(cè)序也很早就在做了,樣本和數(shù)據(jù)更多。”


  而更多的挑戰(zhàn)還是來自老問題:錯(cuò)誤率高。


  興證醫(yī)藥研報(bào)指出,第三代基因測(cè)序單讀長(zhǎng)錯(cuò)誤率依然偏高,在15%-40%,二代測(cè)序的錯(cuò)誤率低于1%。前述中小企業(yè)投資機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人告訴記者:“單分子測(cè)序不需要切斷DNA和RNA序列,看重對(duì)堿基對(duì)一下子讀下去能讀多長(zhǎng),而影響讀長(zhǎng)的一個(gè)是機(jī)器,一個(gè)是生物合成酶。”


  廣發(fā)證券也指出,單分子測(cè)序可收集到的信號(hào)非常弱,這對(duì)光電元件提出很高要求,雖然目前部分儀器已經(jīng)實(shí)現(xiàn)商業(yè)化,但離理想狀態(tài)還有較大距離。另外,還有測(cè)序通量不高、插入缺失錯(cuò)誤等不足之處,這都影響了三代測(cè)序的推廣。


  值得一提的是,與其他國產(chǎn)測(cè)序儀一樣,瀚?;驕y(cè)序儀核心零部件依舊需要進(jìn)口,例如光學(xué)系統(tǒng)中的部分核心器件來自日本、德國,測(cè)序芯片和微流控系統(tǒng)需來自新加坡、美國。



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