新一代測序技術(shù)面臨數(shù)據(jù)存儲、解讀以及標(biāo)準(zhǔn)化問題


時(shí)間:2014-06-18





  隨著微生物基因組信息逐漸增多,新一代測序技術(shù)在抗細(xì)菌和抗病毒藥物研發(fā)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,尤其在追蹤其耐藥突變方面。然而,目前這些研究多出自于學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu),很少來自于制藥公司。細(xì)菌和病毒經(jīng)常會對現(xiàn)有藥物產(chǎn)生耐藥性,通過下一代測序技術(shù)理解微生物的耐藥突變對未來抗傳染病藥物開發(fā)尤為重要。

  在疫苗的質(zhì)量控制中使用新一代測序技術(shù),可以更早地檢測到生產(chǎn)流程中的外源病毒污染。未來,新一代測序技術(shù)將用于監(jiān)測疫苗使用的整個(gè)過程,評估其安全性、效率以及在不同宿主中的反應(yīng)差異。

  
  新一代測序逐漸開始在生物制藥領(lǐng)域的應(yīng)用,尤其是在抗體庫的構(gòu)建領(lǐng)域。聯(lián)合使用新一代測序和熒光定量PCR技術(shù)的方法,相比傳統(tǒng)的噬菌體抗體庫技術(shù)速度更快、成本更低,而且對抗體庫多樣化的后續(xù)分析更為精確。

  另外,通過新一代測序和噬菌體cDNA文庫技術(shù)的聯(lián)合使用,可以識別某個(gè)多功能酶的新互作蛋白,或者已知互作蛋白的新結(jié)合域。相比傳統(tǒng)方法如酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)以及一代測序速度更快,信息量更大。
  

  目前新一代測序技術(shù)在藥物研發(fā)上的應(yīng)用還屬初級階段,同樣面臨著數(shù)據(jù)存儲、解讀以及標(biāo)準(zhǔn)化的問題。新一代測序技術(shù)的出現(xiàn)對于藥物研發(fā)具有里程碑的意義,現(xiàn)有的應(yīng)用貫穿了早期研發(fā)到臨床實(shí)驗(yàn)的各個(gè)階段。隨著未來測序成本的降低,大數(shù)據(jù)分析能力增強(qiáng),基因診斷和個(gè)體化治療的不斷發(fā)展,越來越多效率更高、副作用更小、更為特異的新藥將會不斷涌現(xiàn)。
  

  近幾年興起的直接面向用戶的個(gè)人DNA信息咨詢產(chǎn)業(yè)其實(shí)是基因檢測市場化產(chǎn)物,基本模式是利用互聯(lián)網(wǎng)和快遞寄送,將檢測試劑盒送至用戶手中,再由其將采集的唾液及時(shí)送回公司,并從中提取用戶的DNA,檢測結(jié)果也可直接從網(wǎng)上查詢獲取。
  

  目前這些公司絕大部分只能對已知的目標(biāo)基因進(jìn)行檢測,靠大量的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果計(jì)算百分比,生物學(xué)意義和臨床意義都不大,但隨著基因與人類疾病健康關(guān)系的深入揭示,以及全基因組測序的普及,個(gè)人的遺傳信息對臨床個(gè)體化治療將越來越具有指導(dǎo)意義。
  

  現(xiàn)代醫(yī)學(xué)觀念變化之一是從“治療”向“預(yù)防”轉(zhuǎn)變,實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)的有效手段之一就是建立個(gè)人遺傳健康檔案以及重大疾病預(yù)警機(jī)制。要達(dá)到及早預(yù)防的目的,必須充分了解基因與人類疾病健康的關(guān)系,這還需依賴臨床數(shù)據(jù)庫的不斷積累,并通過生物信息解讀展開充分發(fā)掘。
  

  監(jiān)管規(guī)范與基礎(chǔ)生物信息學(xué)仍是目前制約新一代測序技術(shù)應(yīng)用的主要瓶頸。監(jiān)管與規(guī)范化問題有望隨著試點(diǎn)審批以及相關(guān)注冊法規(guī)逐步完善而解決,技術(shù)相對成熟的生育健康領(lǐng)域?qū)⒆钕然謴?fù)發(fā)展,重回快速增長的軌道。
  

  生物信息學(xué)的發(fā)展,關(guān)于人類健康與基因關(guān)系的研究過程相對漫長,有賴于大數(shù)據(jù)等新技術(shù)的應(yīng)用的支持,但對每一個(gè)病種或者每一個(gè)基因研究的突破都將打開一片新的市場空間。當(dāng)大量生物信息大數(shù)據(jù)被解讀,基因測序市場將與疾病預(yù)防相結(jié)合,開啟新的技術(shù)時(shí)代。

來源:中國產(chǎn)業(yè)競爭情報(bào)網(wǎng)



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