"大數(shù)據(jù)+基因測序"助推腫瘤靶向藥物研發(fā)


作者:裘炯華    時間:2016-02-03





  基因測序可以為腫瘤的早期篩查、早期診斷和藥物研發(fā)提供重要依據(jù),并為腫瘤精準醫(yī)學的實施奠定基礎(chǔ)。近日,“百度—協(xié)和醫(yī)學院食管癌研究項目”在北京協(xié)和醫(yī)學院舉辦簽約儀式,雙方將充分發(fā)揮北京協(xié)和醫(yī)學院的醫(yī)學研究優(yōu)勢和百度大數(shù)據(jù)與人工智能等技術(shù)優(yōu)勢,發(fā)現(xiàn)與中國人密切相關(guān)的食管癌早期診斷的標志物,為食管癌的早期篩查和診斷提供科學依據(jù),并為食管癌靶向藥物的研發(fā)提供靶點依據(jù)。


  生物標志和靶點研究緊迫


  據(jù)估算,全球50%以上的食管癌患者在我國。由于缺乏早期診斷的標志物,大部分患者發(fā)現(xiàn)時已是晚期,加上缺乏有效的臨床治療藥物,患者的5年生存率僅為10%左右。


  分子腫瘤學國家重點實驗室研究員、博士生導師劉芝華表示:“目前,歐美的食管癌研究對我國醫(yī)學界并無太多借鑒價值。因此,進行食管癌全基因組的測序分析和功能研究,找出食管癌早期診斷的生物標志和藥物靶點迫在眉睫?!?/br>


  中國工程院院士、分子腫瘤學國家重點實驗室主任詹啟敏介紹說:“由于缺乏早期診斷的標志物,我國食管癌的臨床治療效果欠佳。實際上,今天科技的進步使不少的癌癥已經(jīng)有了較有效的控制藥物,但食管癌在靶向藥物治療方面幾乎還是空白?!?/br>


  據(jù)了解到,分子靶向治療通過作用于腫瘤細胞特定靶點,在多種腫瘤中顯示出良好的療效。在食管癌的治療中也相繼有一些藥物進行了臨床探索和應(yīng)用。現(xiàn)實情況下,在EGFR、HER2+、等通路的靶向藥物中,多數(shù)Ⅱ、Ⅲ期臨床研究結(jié)果令人失望。此外,還有一些新靶向藥物的研究結(jié)果值得期待。目前大多數(shù)食管癌相關(guān)靶向研究均來自于西方人群的食管腺癌或食管胃結(jié)合部癌,國內(nèi)數(shù)據(jù)相對缺乏,期待國內(nèi)進行的尼妥珠單抗的臨床研究能帶來振奮人心的結(jié)果。


  互聯(lián)網(wǎng)改變醫(yī)療需深層探索


  實際上,我國在食管癌基因測序、遺傳突變方面的研究一直都在悄然開展。由詹啟敏領(lǐng)銜的中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院分子腫瘤學國家重點實驗室研究團隊近些年與華大基因、汕頭大學醫(yī)學院等單位的科研人員合作,通過高通量測序、比較基因組雜交芯片分析、生物學功能和臨床驗證研究,系統(tǒng)地揭示了食管鱗癌的遺傳突變背景,發(fā)現(xiàn)了與食管鱗癌發(fā)生發(fā)展進程和臨床預后相關(guān)的基因。


  據(jù)詹啟敏介紹,對潛在治療靶點進行分析,發(fā)現(xiàn)PI3K是食管鱗癌突變頻率最高的潛在藥靶,并發(fā)現(xiàn)PSMD2、RARRES1、


  SRC、GSK3β和SGK3等潛在新藥靶。據(jù)悉,2014年5月1日,《自然》雜志正式發(fā)表了上述重大科學成果。


  據(jù)了解,此次“百度—協(xié)和醫(yī)學院食管癌研究項目”在實施層面由北京協(xié)和醫(yī)學院分子腫瘤學國家重點實驗室承擔。按照計劃,合作項目將于2016年初啟動,在兩年內(nèi)完成1500例食管癌患者的組織樣本收集,100個食管癌家系血液樣本的收集,并將在2017年年前完成整個項目的測序和生物分析工作。


  詹啟敏認為,目前腫瘤最有效的防治措施是早期篩查和早期診斷。協(xié)和與百度合作,1500名樣本分析的數(shù)據(jù)量,目前在全世界是最大的。


  此外,開展食管癌的醫(yī)學研究需要進行的全基因組測序和比對過程中會產(chǎn)生大量數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)的存儲、生物學分析、臨床相關(guān)性分析都需要巨大的數(shù)據(jù)存儲與運算能力。


  “基因測序產(chǎn)生的數(shù)據(jù)需要大量的存儲空間,測序后的處理和分析需要強大的計算資源,這些能力正是百度所擅長的。進一步講,百度在分布式計算方法與算法上有深厚的積累,會有助于測序后結(jié)果的比對等分析的效率與效果?!卑俣妊芯吭焊痹洪L張潼表示。


  在中國大力推進精準醫(yī)療的大時代背景下,“互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)療”已經(jīng)成為一個耳熟能詳?shù)慕M合。對此,張潼認為:“目前,很多‘互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)療’的做法和嘗試,層次比較淺。比如現(xiàn)在實踐較多的掛號平臺,作用是連接人和醫(yī)院,但掛號資源本身有限,最后把號分給誰,還需要更深的智能化。”


  “至于怎么用互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)改變醫(yī)療,比如精準醫(yī)療、個性化醫(yī)療,乃至未來的智能診斷、智能健康護理,這些其實還在起步階段?!睆堜M一步表示。(裘炯華)


來源:中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)導報



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