國家基因庫開幕在即 將成為全球最大生命信息平臺


時間:2016-09-09





  耗時5年,由國家發(fā)改委等4部委批復(fù)、華大基因承建運(yùn)營的首個國家基因庫已進(jìn)入收官階段,將于9月22日正式開幕。


  這是中國第一個、全球第四個國家級基因庫。21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者獲悉,國家基因庫已與國外多個國家級自然歷史博物館、挪威世界末日種子庫等機(jī)構(gòu)建立合作,開幕之后也將正式開放數(shù)據(jù)共享平臺。


  國家基因庫主任、華大農(nóng)業(yè)集團(tuán)董事長兼總裁梅永紅告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者:“作為國家級平臺,基因庫的公共平臺屬性、功能非常明確,即提供公共產(chǎn)品和公共服務(wù)。將來,基因庫也會衍生出一些產(chǎn)業(yè)門類,我們希望通過這個平臺有更多人、更多模式走出來,這對提升國家在生命科技領(lǐng)域的能力是非常有價值的?!?/br>


  梅永紅曾任山東濟(jì)寧市市長一職,一年前辭官引起業(yè)界嘩然。巧合的是,他“投奔”的華大基因也在十年前從北京走出體制南下深圳,華大基因研究院至今仍為事業(yè)單位。


  綜合性世界最強(qiáng)


  中國的基因庫建設(shè)比多數(shù)發(fā)達(dá)國家晚幾十年,國家基因庫是繼美國國家生物技術(shù)信息中心NCBI、歐洲生物信息研究所EBI、日本DNA數(shù)據(jù)庫DDBJ之后,全球第四個國家級基因庫。


  但中國國家基因庫具有其他三國尚未具備的功能。


  “他們只是數(shù)據(jù)庫,沒有樣品保存功能。相比之下,國家基因庫還有樣品庫和活體庫,目前全球沒有這么大規(guī)模的綜合性數(shù)據(jù)庫,我們一期就達(dá)到了。”華大基因研究院院長、國家基因庫執(zhí)行主任徐訊向21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者表示。


  國家基因庫分兩期建設(shè),即將開幕的是一期,工程投資7.8億元,建筑面積4.75萬平方米,目前基因信息數(shù)據(jù)總量達(dá)60PB,生物樣本存儲能力1000萬份。


  從架構(gòu)來看,國家基因庫將打造“三庫兩平臺”,三庫由生物信息數(shù)據(jù)庫、生物樣本資源庫和生物活體庫組成,兩平臺為數(shù)字化平臺及合成與基因編輯平臺。


  值得關(guān)注的是,生物活體庫是全球第一個為生物多樣性研究和保護(hù)提供資源的平臺,包含重要物種保護(hù)和繁育技術(shù),從水生物拓展至動植物和微生物等,并建立了醫(yī)學(xué)健康基地。


  生物多樣性在全球受到高度重視,但中國在此方面的理解普遍存在差距。


  國家基因庫副主任,華大基因研究院副院長張國捷告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者:“我們希望借用這個平臺搜集全球資源研究整個生物多樣性。目前生物多樣性主要分為基礎(chǔ)研究方向和應(yīng)用方向,基礎(chǔ)研究主要回答重大基礎(chǔ)性的生物學(xué)問題。應(yīng)用方向剛剛起步,我們希望通過探索基因資源,在未來對生物新能源、新醫(yī)藥和新材料科學(xué)應(yīng)用研究上提供重要的基礎(chǔ)知識和樣品儲備。”


  數(shù)據(jù)方面,國家基因庫主要產(chǎn)生人類疾病和物種多樣性的相關(guān)數(shù)據(jù)。人類疾病數(shù)據(jù)主要通過與醫(yī)院合作臨床研究和自愿參與科研計(jì)劃獲得,國家基因庫將通過公眾號等途徑不定期發(fā)布科研志愿者項(xiàng)目。


  目前,罕見病數(shù)據(jù)庫已檢測了3000多個家庭,新發(fā)現(xiàn)400多種罕見?。话┌Y數(shù)據(jù)庫包含上萬份不同種類的數(shù)據(jù),其中國際癌癥組織聯(lián)盟存入的數(shù)據(jù)信息占了不小比重;其余則是大規(guī)模人群隊(duì)列數(shù)據(jù)庫。


  而物種多樣性數(shù)據(jù)則是與多個國家的自然歷史博物館等機(jī)構(gòu)合作。徐訊進(jìn)一步解釋:“基因庫會開展大規(guī)模的全球合作,希望把國際資源集中起來應(yīng)用和挖掘數(shù)據(jù),并把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成有用的信息和知識?!?/br>


  最具現(xiàn)實(shí)價值的是,上述龐大的數(shù)據(jù)量將通過數(shù)據(jù)共享中心向全國科研機(jī)構(gòu)和人員、產(chǎn)業(yè)機(jī)構(gòu)開放。梅永紅告訴21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者:“國家基因庫設(shè)有理事會,由國家發(fā)改委、財政部、工信部、衛(wèi)計(jì)委四部委牽頭,深圳市政府共同參與。這個平臺怎么建設(shè)、運(yùn)營,按照什么樣的機(jī)制實(shí)現(xiàn)資源共享,都由理事會建立標(biāo)準(zhǔn)。”


  平衡公共與商業(yè)屬性


  在一期7.8億的工程投資款中,華大基因配套投資了3.6億。梅永紅直言,承建運(yùn)營國家基因庫的任務(wù)落在華大基因身上,是因?yàn)槿A大基因解讀基因遺傳密碼的能力在全球領(lǐng)先,可以有效利用基因資源。另外,華大基因也是全球基因數(shù)據(jù)量最大的機(jī)構(gòu)之一,是國家基因庫資源的重要來源。


  而對于公共性與商業(yè)性的界限,徐訊表示:“國家基因庫是完全獨(dú)立的,雖然由華大團(tuán)隊(duì)建設(shè)和管理,但與我們的商業(yè)版塊是物理隔離的?;驇鞎峁ν夤卜?wù)統(tǒng)一的政策和規(guī)則,產(chǎn)業(yè)機(jī)構(gòu)包括華大都必須按照規(guī)則使用這個公共平臺?!?/br>


  華大基因也曾是體制內(nèi)的一員,2003年開始隸屬于中科院旗下的北京基因組所。短短三年后,華大基因脫離中科院體系南下深圳。2007年成立的華大基因研究院至今保留著事業(yè)單位的頭銜。


  如今,華大基因擁有四個商業(yè)版塊和一個創(chuàng)投平臺:華大農(nóng)業(yè)主攻基因在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用;華大智造主要從事體外診斷試劑、測序儀等設(shè)備研發(fā)生產(chǎn)和銷售;華大股份負(fù)責(zé)科技服務(wù)和醫(yī)學(xué)檢測;新成立的華大司法提供司法鑒定等服務(wù);藍(lán)色彩虹則負(fù)責(zé)基因領(lǐng)域的創(chuàng)投孵化。


  另外還有四個非營利機(jī)構(gòu):華大基因研究院、華大學(xué)院、GigaScience雜志以及國家基因庫。


  去年年底,華大基因旗下的華大股份披露IPO沖刺創(chuàng)業(yè)板,華大股份由華大醫(yī)學(xué)和華大科技合并而成。


  而智造版塊先后推出了超級測序儀Revolocity和桌面型高通量測序儀BGISEQ-500.21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道記者在國家基因庫看到,目前已經(jīng)有150臺BGISEQ-500和1臺超級測序儀投入使用。


  “華大是做基礎(chǔ)研究起步的機(jī)構(gòu),做整個方向選擇或架構(gòu)時在摸索一個新的成長模式:首先確認(rèn)一個大目標(biāo),再集中大資源、搭建大平臺、開展國際合作,通過這些獲取大數(shù)據(jù),最終形成大科學(xué),衍生出各個產(chǎn)業(yè)化機(jī)構(gòu)?!泵酚兰t說。

來源:21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道



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