大數(shù)據(jù)為藥物研發(fā)助力


來源:中國醫(yī)藥報(bào)   作者:白毅    時(shí)間:2016-11-25





  隨著制藥行業(yè)數(shù)據(jù)的不斷積累和生命科學(xué)及健康領(lǐng)域數(shù)據(jù)的蓬勃發(fā)展,大數(shù)據(jù)在新藥研發(fā)中起到越來越重要的作用。近日,有關(guān)專家在接受記者采訪時(shí)表示,大數(shù)據(jù)已成為藥物研發(fā)領(lǐng)域的關(guān)鍵因素,對(duì)于大數(shù)據(jù)的擁有及正確的應(yīng)用將成為今后藥物研發(fā)競爭的重點(diǎn)所在。


  藥物研發(fā)的迫切需求


  藥渡項(xiàng)目管理部運(yùn)營總監(jiān)李琪介紹,藥物研發(fā)是一個(gè)高投入、高風(fēng)險(xiǎn)、長周期的工作,其研發(fā)費(fèi)用動(dòng)輒數(shù)十億美元,研發(fā)周期長達(dá)10~15年,而成功率卻微乎其微。如果能在藥物研發(fā)早期獲得足夠的數(shù)據(jù),創(chuàng)建更為有效的開發(fā)流程,針對(duì)最有希望的產(chǎn)品優(yōu)先分配資源,不僅能夠提高研發(fā)效率,更能降低失敗風(fēng)險(xiǎn)。


  “新藥研發(fā),已經(jīng)離不開大數(shù)據(jù)的支撐?!毕踢_(dá)數(shù)據(jù)旗下信狐藥訊聯(lián)合創(chuàng)始人王海林表示,藥物篩選、立項(xiàng)、臨床、上市等所有環(huán)節(jié),都需要大數(shù)據(jù)的支撐。如通過大數(shù)據(jù)分析,可以提高效率,縮短周期,降低風(fēng)險(xiǎn),節(jié)約成本;利用化學(xué)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),可以幫助研發(fā)者快速確立化學(xué)結(jié)構(gòu)或有針對(duì)性進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造;利用深度學(xué)習(xí)、虛擬篩選數(shù)據(jù),能夠快速分析藥物臨床前實(shí)驗(yàn),找出有效的目標(biāo)藥物;利用臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù),可以快速建立藥代動(dòng)力學(xué)模型,評(píng)估療效,預(yù)判不良反應(yīng),加快臨床試驗(yàn)速度。


  湯森路透產(chǎn)品解決方案部門李寅博士認(rèn)為,在眾多涉及大數(shù)據(jù)的行業(yè)中,制藥行業(yè)是真正的數(shù)據(jù)密集型的專業(yè)領(lǐng)域,尤其是未來創(chuàng)新藥的探索與開發(fā)將與大數(shù)據(jù)密不可分。


  李琪表示,新藥研發(fā)的相關(guān)數(shù)據(jù)量巨大,每一個(gè)成功上市的藥物背后都有上百萬頁的文獻(xiàn)資料,同時(shí)藥物研發(fā)數(shù)據(jù)涵蓋藥學(xué)、藥理、毒理、藥代動(dòng)力學(xué)、藥學(xué)專利、藥物化學(xué)(合成)、臨床藥理學(xué)、藥劑學(xué)、藥物分析學(xué)等十幾個(gè)學(xué)科研究領(lǐng)域。在藥物研發(fā)的過程中,必須“站在巨人的肩膀上”進(jìn)行創(chuàng)新。如果研究人員對(duì)已上市藥物的各項(xiàng)學(xué)科數(shù)據(jù)了如指掌,在此基礎(chǔ)上開展的創(chuàng)新研究的成功機(jī)會(huì)就會(huì)增加很多。然而,在當(dāng)今這個(gè)信息大爆炸的時(shí)代,每天都有海量的化學(xué)反應(yīng)、醫(yī)藥文獻(xiàn)、專利申請(qǐng)等藥物相關(guān)數(shù)據(jù)文獻(xiàn)被公開發(fā)表,藥物的文獻(xiàn)調(diào)研和閱讀絕非易事。比如,全球已上市糖尿病藥物近30個(gè),每個(gè)藥物的文獻(xiàn)資料約2萬頁,那么要開發(fā)一個(gè)糖尿病新藥,需要把所有已上市糖尿病藥物百萬頁的相關(guān)資料都閱讀一遍。即使是對(duì)于一個(gè)有10年研發(fā)經(jīng)驗(yàn)的高級(jí)藥物研發(fā)人員來說,閱讀這么大量的文獻(xiàn)也是個(gè)不可能完成的任務(wù),這是有限的生命與研發(fā)創(chuàng)新之間最大的矛盾。如何讓藥物研發(fā)人員能夠迅速了解所關(guān)注藥物的歷史數(shù)據(jù),讓藥物研發(fā)創(chuàng)新開展得更高效,是全球需要解決的問題。解決了這一難題,藥物研發(fā)創(chuàng)新的成功機(jī)會(huì)就會(huì)顯著提高。


  從整合、分析到解讀


  在藥物研發(fā)領(lǐng)域中,大數(shù)據(jù)具有信息量大、信息種類繁多、數(shù)據(jù)產(chǎn)生的速度快等特點(diǎn)。李寅強(qiáng)調(diào),最重要的不僅僅是數(shù)量,而是對(duì)于數(shù)據(jù)的“整合”“分析”與“解讀”。大家競爭的不再是誰可以獲得某個(gè)信息,而是誰可以從浩瀚的數(shù)據(jù)海洋中快速地找到那些真正具有價(jià)值的“珍珠”,或通過對(duì)于數(shù)據(jù)的分析,及時(shí)總結(jié)出規(guī)律,發(fā)現(xiàn)“深海采珠”的捷徑。


  李寅首先從數(shù)據(jù)的整合角度介紹,藥物研發(fā)領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)在具備準(zhǔn)確性、時(shí)效性、全面性的基礎(chǔ)上,在不同種類、不同層次、不同維度還應(yīng)該構(gòu)建合理的相關(guān)性,即將“知識(shí)孤島”連接起來,聯(lián)點(diǎn)成線,組線成網(wǎng),進(jìn)一步形成立體結(jié)構(gòu)。這種關(guān)聯(lián)性在很大程度上可以決定基礎(chǔ)信息數(shù)據(jù)是否能夠通過人工或者某種人工智能最終上升成為知識(shí),并進(jìn)一步幫助人們產(chǎn)生新的假設(shè),完成新的構(gòu)想,推動(dòng)研發(fā)活動(dòng)的進(jìn)展,產(chǎn)生進(jìn)一步的數(shù)據(jù),并進(jìn)一步升華成知識(shí)。例如:在湯森路透的創(chuàng)新藥研發(fā)數(shù)據(jù)庫INTEGRITY中,所有不同的知識(shí)領(lǐng)域都具有“縱向”相關(guān)性。通過簡單的“快速檢索”,可以查找到與伊馬替尼直接相關(guān)的信息有:7個(gè)靶點(diǎn),1314個(gè)生物標(biāo)記物,6929篇文獻(xiàn),418個(gè)核心專利,27條全合成路徑,1857個(gè)實(shí)驗(yàn)藥理學(xué)數(shù)據(jù),2646個(gè)PKPD數(shù)據(jù),1807個(gè)臨床試驗(yàn)記錄,11家公司或研究機(jī)構(gòu),8個(gè)疾病的綜述以及115個(gè)實(shí)驗(yàn)?zāi)P汀Mㄟ^這個(gè)專業(yè)工具,可以在幾秒鐘內(nèi)全面收集該藥的主要信息及研發(fā)數(shù)據(jù)。


  其次,數(shù)據(jù)的呈現(xiàn)及分析方式對(duì)于是否能夠全面挖掘數(shù)據(jù)的潛在價(jià)值起到?jīng)Q定性作用。李寅認(rèn)為,尤其在制藥行業(yè)中,通過數(shù)據(jù)分析并借助一定的可視化手段,可以從繁多的數(shù)據(jù)中找到線索,發(fā)現(xiàn)問題的核心,為解決問題提供正確方向。在新藥立項(xiàng)之前,往往要對(duì)靶點(diǎn)的作用機(jī)制進(jìn)行深入調(diào)研,從臨床前、市場潛力、臨床、專利等方面確定新藥分子在未來市場中的前景及可能遇到的各種風(fēng)險(xiǎn)。數(shù)據(jù)分析及呈現(xiàn)方式的選擇直接影響到受眾對(duì)于數(shù)據(jù)的理解,從而影響到最終的決策。如在湯森路透的競爭情報(bào)模塊(CortellisforCI)中,可以查找近幾年來糖尿病領(lǐng)域中比較新的靶點(diǎn)SGLT-2領(lǐng)域中的所有藥物(共54個(gè)),并對(duì)這些藥物進(jìn)行分析,如分析這些藥物的研發(fā)進(jìn)展(10個(gè)藥物上市,4個(gè)提交新藥申請(qǐng),7個(gè)藥物在Ⅲ期臨床研究階段,5個(gè)藥物在Ⅱ期臨床研究階段等),分析研發(fā)藥物數(shù)量最多的機(jī)構(gòu)(阿斯利康、禮來、賽諾菲等公司),治療的適應(yīng)證,或是研發(fā)技術(shù)類別等。這些全面的信息可以為研發(fā)立項(xiàng)決策提供大量情報(bào),分析呈現(xiàn)出的結(jié)果清晰并有說服力。


  而最重要的一點(diǎn),則在于大數(shù)據(jù)的“解讀”。這也是任何規(guī)模的數(shù)據(jù)信息最后產(chǎn)生價(jià)值的關(guān)鍵所在,更是大數(shù)據(jù)的整個(gè)生命周期的關(guān)鍵所在。李寅強(qiáng)調(diào),對(duì)于數(shù)據(jù)不正確的解讀,很可能給人們指出錯(cuò)誤的方向,得出有偏差的結(jié)論,增加了新藥項(xiàng)目的決策風(fēng)險(xiǎn)。制藥相關(guān)的數(shù)據(jù)解讀是一個(gè)非常專業(yè)的領(lǐng)域,通常需要借助相關(guān)專業(yè)領(lǐng)域中的專家來做。但由于專家的知識(shí)層次各異,領(lǐng)域稍有差異,結(jié)果可能謬以千里。所以,對(duì)各方專家的觀點(diǎn)都需要進(jìn)行驗(yàn)證。


  機(jī)遇與挑戰(zhàn)并存


  “大數(shù)據(jù)要求有大量的原始數(shù)據(jù)積累,不但要有完整準(zhǔn)確的數(shù)據(jù),還要有持續(xù)生產(chǎn)數(shù)據(jù)的能力,以及科學(xué)的數(shù)據(jù)運(yùn)算、分析。即使是在藥物研發(fā)先進(jìn)的歐美國家,大數(shù)據(jù)的建立也還處于早期階段,尚不完善?,F(xiàn)階段,國內(nèi)在這些方面更是嚴(yán)重欠缺?!崩铉髡J(rèn)為,近年來,國外制藥行業(yè)在新藥研發(fā)過程中對(duì)研發(fā)信息平臺(tái)的依賴性非常高,比如湯森路透的Integrity是國際制藥企業(yè)較為廣泛使用的藥物研發(fā)數(shù)據(jù)庫。但在國內(nèi),此類專業(yè)藥物研發(fā)數(shù)據(jù)信息平臺(tái)幾乎沒有,是藥物研發(fā)的“迫切需求”。


  “藥渡正在不斷摸索如何利用大數(shù)據(jù)為藥物研發(fā)助力?!崩铉鹘榻B,他們自主開發(fā)的藥物大數(shù)據(jù)綜合信息服務(wù)平臺(tái),致力于為醫(yī)藥研發(fā)企業(yè)等提供全面的“一站式藥物研發(fā)大數(shù)據(jù)信息服務(wù)”。目前,平臺(tái)已收錄整理了超過5000個(gè)全球上市和臨床在研的化學(xué)藥和生物藥的科學(xué)數(shù)據(jù),涵蓋藥物立項(xiàng)調(diào)研、研究開展、人才交流等多方面,并通過藥渡網(wǎng)、移動(dòng)應(yīng)用“DrugA-Z”、紙質(zhì)和數(shù)字出版物、藥物研發(fā)對(duì)照品庫、專業(yè)技術(shù)報(bào)告等多種形式與途徑,讓醫(yī)藥研發(fā)信息“觸手可得”,基于藥渡大數(shù)據(jù)出版的紙質(zhì)出版物《ThePharmaceuticalIndex》年卷系列書籍也已出版發(fā)行。


  王海林認(rèn)為,咸達(dá)數(shù)據(jù)現(xiàn)已整合國內(nèi)基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)信息,如專利、藥物批文、注冊(cè)、市場銷售等,為藥物研發(fā)、生產(chǎn)等提供數(shù)據(jù)分析產(chǎn)品。他強(qiáng)調(diào),大數(shù)據(jù)的建立需要綜合多方力量才能實(shí)現(xiàn),必須以開放合作的方式,共同打造服務(wù)于新藥開發(fā)的數(shù)據(jù)平臺(tái)。


  李寅表示,湯森路透曾邀國際制藥巨擘(TOP50)進(jìn)行了以“大數(shù)據(jù)在行業(yè)中的現(xiàn)狀及未來的挑戰(zhàn)”及“大數(shù)據(jù)在制藥領(lǐng)域中的應(yīng)用”為主題的深入調(diào)研。從調(diào)研結(jié)果看出,大數(shù)據(jù)的機(jī)遇挑戰(zhàn)并存。從機(jī)遇角度分析,大數(shù)據(jù)將對(duì)傳統(tǒng)藥物研發(fā)起到至關(guān)重要的作用。40%的受訪者認(rèn)為,大數(shù)據(jù)將在藥物發(fā)現(xiàn)和開發(fā)領(lǐng)域中成為最重要的因素;26.5%的意見認(rèn)為,市場分析將是大數(shù)據(jù)引領(lǐng)制藥行業(yè)的關(guān)鍵。當(dāng)前的一些熱點(diǎn)話題,如精準(zhǔn)醫(yī)療、合作創(chuàng)新、藥物警戒等都將是大數(shù)據(jù)的重要舞臺(tái)。而如何整合結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫,如何充分利用內(nèi)外部的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),如何兼顧社交媒體的數(shù)據(jù)等,是大數(shù)據(jù)面臨的挑戰(zhàn)。在未來的藥物研發(fā)中,誰能有效解決這些問題,誰就可以最大效率地利用數(shù)據(jù),在研發(fā)、生產(chǎn)等競爭中搶得先機(jī)。(本報(bào)記者白毅)



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