預(yù)測人類腫瘤蛋白質(zhì)數(shù)量的新方法

　　研究人員發(fā)明了一種新方法，可測出人類腫瘤組織中蛋白質(zhì)的數(shù)量，新成果發(fā)表在4月在線出版的《自然—方法學(xué)》（Nature Methods）期刊上。

　　蛋白質(zhì)組學(xué)是大規(guī)模研究細(xì)胞蛋白質(zhì)的方法，主要使用質(zhì)譜技術(shù)。通過質(zhì)譜技術(shù)，科學(xué)家們已經(jīng)研制出許多測量生物樣品中蛋白質(zhì)數(shù)量的方法，其中一種方法名為細(xì)胞培養(yǎng)氨基酸穩(wěn)定同位素標(biāo)記SILAC。使用SILAC，生物樣品中的蛋白質(zhì)被含有“重同位素”的氨基酸所標(biāo)記，這種被標(biāo)記的蛋白質(zhì)在質(zhì)譜儀中被去除，因此可與未標(biāo)記的樣品進(jìn)行比較。這種方法需要非常精確的量化分析。然而，這種方法只適用于能夠完全被重氨基酸所代謝標(biāo)記的組織或細(xì)胞。

　　Matthias Mann和同事對SILAC方法進(jìn)行了改進(jìn)，能夠測出人類原發(fā)性腫瘤中的蛋白質(zhì)數(shù)量，而這種腫瘤本身不能被代謝標(biāo)識(shí)。包括腫瘤在內(nèi)的人類組織是由許多種類的細(xì)胞組成，它們能在不同水平上表達(dá)蛋白質(zhì)。為了代表取自特定腫瘤中的許多不同類型的細(xì)胞和蛋白質(zhì)，研究小組用重氨基酸標(biāo)識(shí)了含有不同永生人類癌癥細(xì)胞系的混合物。采用這種超級SILAC方法，他們精確測出人類腫瘤組織中的蛋白質(zhì)數(shù)量，包括乳腺癌和腦癌組織。

　　除了可用于腫瘤生物學(xué)以外，超級SILAC方法還可應(yīng)用于蛋白質(zhì)生物標(biāo)識(shí)的發(fā)現(xiàn)，以檢測早期癌癥。

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