首個普通野生稻全基因組框架圖譜繪制完成


時間:2010-09-07





  最新發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新

  中科院昆明植物研究所研究員高立志及團隊宣布,運用新一代高通量測序技術以及基于高性能超算的生物信息學分析,日前已完成普通野生稻基因組高覆蓋的序列測定、拼接和組裝工作,獲得了普通野生稻全基因組從頭測序的框架圖,基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖譜標準。這是我國科學家自主完成的第一個野生稻全基因組測序計劃,也是世界首個高雜合度野生稻全基因組框架圖譜。

  中國是亞洲栽培稻的起源地之一,水稻是中國第一大糧食作物,養(yǎng)活了80%以上的中國人口。普通野生稻是亞洲栽培稻的公認祖先種,被列為國家二級保護植物,蘊藏著許多尚未認識與利用的優(yōu)異基因。由于它與栽培稻有著密切的親緣關系,迄今水稻常規(guī)育種取得的大多數(shù)突破無不與發(fā)掘利用該種野生稻的優(yōu)異基因相關。例如,袁隆平等利用海南島的一株雄性不育普通野生稻野敗中的細胞質(zhì)雄性不育基因,育成了聞名中外的雜交水稻。

  此前,粳稻日本晴基因組的精細圖譜已經(jīng)獲得,秈稻9311基因組的框架圖譜也由我國科學家完成?,F(xiàn)在普通野生稻全基因組框架圖譜的獲得以及精細圖譜的進一步繪制,不僅大大地促進水稻重要功能基因的規(guī)?;馕雠c鑒定,為進一步發(fā)掘利用普通野生稻豐富的優(yōu)異基因資源提供了前所未有的機遇。

  本項目的完成主要依托于2009年年底順利通過國家驗收的國家大科學工程中國西南野生生物種質(zhì)資源庫先進的基因組學與生物信息學平臺。測序結果已覆蓋92%的普通野生稻全基因組,基因覆蓋度約為90%以上。目前,項目組正在加緊繪制普通野生稻的基因組精細圖譜。

來源:藥品資訊網(wǎng)信息中心



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